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Python连接HDFS实现文件上传下载及Pandas转换文本文件到CSV操作

2020年06月06日 作者：翱翔的江鸟原文

1. 目标

通过hadoop hive或spark等数据计算框架完成数据清洗后的数据在HDFS上

爬虫和机器学习在Python中容易实现

在Linux环境下编写Python没有pyCharm便利

需要建立Python与HDFS的读写通道

2. 实现

安装Python模块pyhdfs

版本:Python3.6, hadoop 2.9

读文件代码如下

from pyhdfs import HdfsClient
client=HdfsClient(hosts='ghym:50070')#hdfs地址
res=client.open('/sy.txt')#hdfs文件路径,根目录/
for r in res:
 line=str(r,encoding='utf8')#open后是二进制,str()转换为字符串并转码
 print(line)

写文件代码如下

from pyhdfs import HdfsClient
client=HdfsClient(hosts='ghym:50070',user_name='hadoop')#只有hadoop用户拥有写权限
str='hello world'
client.create('/py.txt',str)#创建新文件并写入字符串

上传本地文件到HDFS

from pyhdfs import HdfsClient
client = HdfsClient(hosts='ghym:50070', user_name='hadoop')
client.copy_from_local('d:/pydemo.txt', '/pydemo')#本地文件绝对路径,HDFS目录必须不存在

3. 读取文本文件写入csv

Python安装pandas模块

确认文本文件的分隔符

# pyhdfs读取文本文件,分隔符为逗号,
from pyhdfs import HdfsClient
client = HdfsClient(hosts='ghym:50070', user_name='hadoop')
inputfile=client.open('/int.txt')
# pandas调用读取方法read_table
import pandas as pd
df=pd.read_table(inputfile,encoding='gbk',sep=',')#参数为源文件,编码,分隔符
# 数据集to_csv方法转换为csv
df.to_csv('demo.csv',encoding='gbk',index=None)#参数为目标文件,编码,是否要索引

补充知识：记 读取hdfs 转 pandas 再经由pandas转为csv的一个坑

工作流程是这样的：

读取 hdfs 的 csv 文件，采用的是 hdfs 客户端提供的 read 方法，该方法返回一个生成器。

将读取到的数据按 逗号 处理，变为一个二维数组。

将二维数组传给 pandas，生成 df。

经若干处理后，将 df 转为 csv 文件并写入hdfs。

问题是这样的：

正常的数据：

ZERO,MEAN,STD,CV,INC,OPP,CS,IS_OUTNET

0,9.233,2.445,0.265,1.202,241,1,0

0,8.667,1.882,0.217,1.049,179,1,0

三行数据，正常走流程，没有任何问题。

异常数据：

ZERO,MEAN,STD,CV,INC,OPP,CS,IS_OUTNET,probability,prediction

0,9.233,2.445,0.265,1.202,241,1,0,'[0.9653901649086855,0.03460983509131456]',0.0

0,8.667,1.882,0.217,1.049,179,1,0,'[0.9653901649086855,0.03460983509131456]',0.0

在每一行中都会有一个数组类似的数据，有一对引号包起来，中间存在逗号，不可以拆分。

为此，我的做法如下：

匹配逗号是被成对引号包围的字符串。

将匹配到的字符串中的逗号替换为特定字符。

将替换后的新字符串替换回原字符串。

在将原字符串中的特定字符串替换为逗号。

本来这样做没有什么问题，但是在经由pandas转为csv的时候，发现原来带引号的字符串变为了前后各带三个引号。

源数据：

方法如下：

而我每次匹配后都是原封不动替换回去，譬如：

源数据：

"[0.9653901649086855,0.03460983509131456]"

匹配替换后：

"[0.9653901649086855${dot}0.03460983509131456]"

这样传给pandas，它就会认为这个数据是带引号的，在重新转为csv的时候，就会进行转义等操作，导致多出很多引号。

所以解决办法就是在替换之前，将匹配时遇到的引号也去掉：

PATTERN = '(?<=(?P<quote>[\'\"]))([^,]+,[^,]+)+?(?=(?P=quote))'

中间 ([^,]+,[^,]+)+? 要用+？，因为必须确定是有这样的组合才可以，并且非贪婪模式，故不可 ？ 或者 *？

为了说明效果，引用pandas的自带读取csv方法：

之前想的正则有些复杂，反而偏离了本意，还是对正则的认识不够深。

以上这篇Python连接HDFS实现文件上传下载及Pandas转换文本文件到CSV操作就是小编分享给大家的全部内容了，希望能给大家一个参考，也希望大家多多支持来客网。

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